inv_wishart.hpp

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#ifndef __STAN__PROB__DISTRIBUTIONS__MULTIVARIATE__CONTINUOUS__INV_WISHART_HPP__
#define __STAN__PROB__DISTRIBUTIONS__MULTIVARIATE__CONTINUOUS__INV_WISHART_HPP__
 
#include <stan/prob/constants.hpp>
#include <stan/math/matrix_error_handling.hpp>
#include <stan/math/error_handling.hpp>
#include <stan/math/special_functions.hpp>
#include <stan/prob/traits.hpp>
#include <stan/meta/traits.hpp>
#include <stan/agrad/agrad.hpp>
#include <stan/agrad/matrix.hpp>
 
namespace stan {
  namespace prob {
    // InvWishart(Sigma|n,Omega)  [W, S symmetric, non-neg, definite; 
    //                             W.dims() = S.dims();
    //                             n > S.rows() - 1]
    template <bool propto,
              typename T_y, typename T_dof, typename T_scale, 
              class Policy>
    typename boost::math::tools::promote_args<T_y,T_dof,T_scale>::type
    inv_wishart_log(const Eigen::Matrix<T_y,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>& W,
                const T_dof& nu,
                const Eigen::Matrix<T_scale,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>& S,
                const Policy&) {
      static const char* function = "stan::prob::inv_wishart_log(%1%)";
      
      using stan::math::check_greater_or_equal;
      using stan::math::check_size_match;
      using boost::math::tools::promote_args;
 
      typename Eigen::Matrix<T_scale,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>::size_type k = S.rows();
      typename promote_args<T_y,T_dof,T_scale>::type lp(0.0);
      if(!check_greater_or_equal(function, nu, k-1, "Degrees of freedom parameter", 
                                 &lp, Policy()))
        return lp;
      if (!check_size_match(function, W.rows(), W.cols(), &lp, Policy()))
        return lp;
      if (!check_size_match(function, S.rows(), S.cols(), &lp, Policy()))
        return lp;
      if (!check_size_match(function, W.rows(), S.rows(), &lp, Policy()))
        return lp;
      // FIXME: domain checks
        
      Eigen::LLT< Eigen::Matrix<T_y,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> > LLT_W = W.llt();
      if (LLT_W.info() != Eigen::Success) {
        lp = stan::math::policies::raise_domain_error<T_y>(function,
                                              "W is not positive definite (%1%)",
                                              0,Policy());
        return lp;
      }
      Eigen::Matrix<T_y,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> L = LLT_W.matrixL();
 
      using stan::math::dot_product;
      using stan::math::mdivide_left_tri_low;
      using stan::math::crossprod;
      using stan::math::lmgamma;
 
      if (include_summand<propto,T_dof>::value)
        lp -= lmgamma(k, 0.5 * nu);
      if (include_summand<propto,T_dof,T_scale>::value) {
        lp += nu * S.llt().matrixLLT().diagonal().array().log().sum();
      }
      if (include_summand<propto,T_y,T_dof,T_scale>::value) {
        lp -= (nu + k + 1.0) * L.diagonal().array().log().sum();
      }
      if (include_summand<propto,T_y,T_scale>::value) {
        L = crossprod(mdivide_left_tri_low(L));
        Eigen::Matrix<T_y,Eigen::Dynamic,1> W_inv_vec = Eigen::Map<
          const Eigen::Matrix<T_y,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> >(
                                &L(0), L.size(), 1);
        Eigen::Matrix<T_scale,Eigen::Dynamic,1> S_vec = Eigen::Map<
          const Eigen::Matrix<T_scale,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> >(
                                &S(0), S.size(), 1);
        lp -= 0.5 * dot_product(S_vec, W_inv_vec); // trace(S * W^-1)
      }
      if (include_summand<propto,T_dof,T_scale>::value)
        lp += nu * k * NEG_LOG_TWO_OVER_TWO;
      return lp;
    }
 
    template <bool propto,
              typename T_y, typename T_dof, typename T_scale>
    inline
    typename boost::math::tools::promote_args<T_y,T_dof,T_scale>::type
    inv_wishart_log(const Eigen::Matrix<T_y,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>& W,
              const T_dof& nu,
              const Eigen::Matrix<T_scale,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>& S) {
      return inv_wishart_log<propto>(W,nu,S,stan::math::default_policy());
    }
 
 
    template <typename T_y, typename T_dof, typename T_scale, 
              class Policy>
    inline
    typename boost::math::tools::promote_args<T_y,T_dof,T_scale>::type
    inv_wishart_log(const Eigen::Matrix<T_y,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>& W,
                const T_dof& nu,
                const Eigen::Matrix<T_scale,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>& S,
                const Policy&) {
      return inv_wishart_log<false>(W,nu,S,Policy());
    }
 
 
    template <typename T_y, typename T_dof, typename T_scale>
    inline
    typename boost::math::tools::promote_args<T_y,T_dof,T_scale>::type
    inv_wishart_log(const Eigen::Matrix<T_y,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>& W,
            const T_dof& nu,
            const Eigen::Matrix<T_scale,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>& S) {
      return inv_wishart_log<false>(W,nu,S,stan::math::default_policy());
    }
 
 
  }
}
#endif